背景设定是托勒密末期，这个年代实际上和大家印象中的造金字塔那个古埃及年代差了千百年，这个王朝实际上是希腊人(马其顿)统治了的，在末期也遭到了罗马共和国势力的介入，所以玩家看到的是一个希腊和古埃及文化融合后的年代。 埃及是一个神奇的国度，有着悠久的历史和美丽的风景。当初制作组在做调查的时候，发现埃及有很多东西可以用来丰富刺客信条的内容，所以选择在这里讲述兄弟会的起源。游戏除了埃及之外，还可以通过航船系统探索其他国家，比如希腊，以及整个地中海地区，海战依然会出现在本作中。